La Microbiología Clínica es una especialidad médica encargada del diagnóstico de las enfermedades infecciosas. Éstas, constituyen actualmente la 3ª causa de mortalidad en el mundo occidental, tras los accidentes cerebro-vasculares y el cáncer. De ahí, la importancia de un buen diagnóstico etiológico con la finalidad de adecuar el tratamiento empírico para tratar dichas infecciones. El correcto diagnóstico etiológico es fundamental para establecer el pronóstico de estas enfermedades. Por ello, es muy importante la correcta recogida, almacenamiento, conservación y transporte de las muestras al laboratorio de microbiología. La muestra debe ser siempre representativa del proceso infeccioso, para una correcta optimización del diagnóstico. Además, la muestra debe ser suficiente para todas las determinaciones que se solicitan, de lo contrario habrá que priorizar el diagnóstico contactando con el facultativo peticionario. El personal de Enfermería es el encargado, en la mayoría de los casos, de la recogida y el envío de dichas muestras, por lo que es prioritario el conocimiento de los procesos y procedimientos para su correcta recogida. En este texto, se resume la metodología para la recogida de los principales tipos de muestras clínicas, por lo que una lectura atenta es altamente recomendable.